Componentes da Holoenzima: (1) A Enzima Central e (2) O Fator Sigma

A polimerase de RNA completa de E. coli é conhecida como holoenzima. A holoenzima consiste nos seguintes dois componentes: (1) a enzima do núcleo e (2) o fator sigma. A holoenzima pode ser simbolizada como α ₂ β β 'σ. !

1. A Enzima Central:

A enzima do núcleo não pode iniciar a transcrição nos locais apropriados, mas pode sintetizar o RNA usando o DNA como modelo.

O núcleo de RNA polimerase consiste em quatro polipeptídeos que são dos seguintes três tipos:

(a) Subunidade α:

Está presente em duas cópias / molécula enzimática central e está relacionado com a ligação ao ADN promotor. O mecanismo exato de sua ligação com o DNA é desconhecido.

(b) A subunidade β:

Está presente numa única molécula de cópia / enzima e está envolvida na ligação com os nucleótidos que entram para a síntese de ARN. O reconhecimento dos nucleotídeos corretos em relação às bases do DNA parece basear-se em sua geometria geral em relação um ao outro, e não no comportamento de pareamento das bases.

(c) A subunidade β ':

Está envolvido na ligação com o DNA molde, isto é, o trecho de DNA de cadeia simples gerado para permitir que a transcrição continue.

Cada subunidade contribui para a função da enzima central como um todo, que deve ter pelo menos os seguintes quatro locais funcionais distintos.

(i) Um local de desenrolamento de DNA que mantém o desenrolar do duplex de DNA como a enzima do núcleo move-se uma base de cada vez ao longo do DNA que está sendo transcrito.

(ii) O site que se liga à 'cadeia anti-sentido', a cadeia que é transcrita.

(iii) Um outro sítio liga-se à "cadeia de sentido", a cadeia complementar à "cadeia anti-sentido", do ADN a ser transcrito.

(iv) Um local de rebobinamento do DNA está relacionado ao rebobinamento das duas fitas de DNA em um duplex normal.

2. O fator Sigma:

O fator sigma está envolvido na ligação estável da RNA polimerase ao DNA promotor; e possivelmente com iniciação de transcrição. Não está envolvido na transcrição per se (ou seja, síntese de RNA), uma vez que é liberado quando a cadeia de RNA atinge 8-9 bases; a enzima central continua a transcrição.

RNA polimerase em eucariotos:

Todos os eucariotos possuem três classes distintas de RNA polimerase chamadas RNA polimerase I, RNA polimerase II e RNA polimerase III.

RNA polimerase I:

Esta enzima está localizada no nucléolo e é responsável pela transcrição do RNA ribossômico.

RNA polimerase II:

Esta polimerase está localizada no nucleoplasma que faz parte do núcleo que não o nucléolo. Esta enzima é o principal componente da atividade da RNA polimerase e transcreve todos os genes que produzem mRNA. Em eucariotos, o transcrito está inicialmente na forma de precursores de mRNA, chamado RNA nuclear heterogêneo (hn RNA), que são posteriormente processados ​​em mRNA.

RNA polimerase III:

Essa enzima ocorre no nucleoplasma e transcreve os genes RNAt e RNA 5S.

RNA polimerase organelar:

Além das RNA polimerases nucleares I, II e III, as células eucarióticas possuem uma pequena quantidade de atividade da RNA polimerase em suas organelas, ou seja, mitocôndrias e plastídios. Essas polimerases são necessárias para transcrever relativamente poucos genes presentes nessas organelas. Estas enzimas parecem ser análogas às polimerases de ARN do fago.